بخش ویروس شناسی در دانشگاه علوم پزشکی ایران با توجه به نیاز مرکز خدمات آموزشی و درمانی حضرت رسول اکرم (ص) در سال 1373 راه اندازی گردید و پس از شش ماه کلیه تجهیزات ساختمانی، دستگاه ها و وسایل آزمایشگاهی فراهم شد. در سال 1374 این مرکز مجوز تربیت دانشجویان ویروس شناسی در سطح کارشناسی ارشد را اخذ کرد. همچنین در سال 1378 مجوز پذیرش دانشجو در سطح PhD ویروس شناسی به این بخش اهدا گردید، قابل ذکر است که در زمان فوق الذکر بخش ویروس شناسی همراه با میکروب شناسی و ایمونولوژی یک  گروه آموزشی محسوب می شدند و فقط در این بین ویروس شناسی دارای مجوز تربیت دانشجویان تحصیلات تکمیلی بود، به علاوه تنها گروه فارماکولوژی و ویروس شناسی اجازه تربیت دانشجویان PhD را داشتند. پس از یک سال واحد ویروس شناسی به عنوان یک واحد مستقل از باکتری شناسی مجزا گردید و جهت دانشجویان پزشکی نیز درس ویروس شناسی به عنوان یک واحد مستقل با نمره مستقل محسوب شد.
در سال 1380 گروه ویروس شناسی به عنوان یک گروه مستقل در دانشگاه با مجوز وزارت بهداشت تأسیس شد که ضمناً اولین گروه ویروس شناسی در کشور محسوب می شد. از آن به بعد تعداد زیادی دانشجو در مقاطع کارشناسی ارشد، PhD در این گروه تحصیل نموده و فارغ التحصیل شده اند و در دانشگاه ها و مراکز پژوهشی مشغول به آموزش و پرورش و خدمت رسانی می باشند.